Em Shin Godzilla, a primeira aparição do monstro começa com um navio desgovernado que se aproxima de um porto vazio, causando tensão entre os oficiais que observam o ocorrido. De repente, a água ao redor começa a borbulhar violentamente, e Godzilla emerge do mar, inicialmente em uma forma deformada e desordenada, com uma cauda grotesca e uma carne gelatinosa. O monstro, ainda instável, provoca destruição ao seu redor. Seu tamanho e aparência são assustadores, e seu comportamento parece confuso, dando a impressão de que está em um estágio primitivo de evolução.

À medida que Godzilla avança para a terra, ele começa a passar por uma transformação radical. Sua espinha dorsal brilha intensamente, sinalizando que está ativando uma energia nuclear interna. A criatura começa a se erguir, ganhando estabilidade e uma postura bípede, com as famosas barbatanas surgindo nas costas, iluminadas por radiação. Ele emite rajadas destrutivas de radiação, devastando tudo ao seu redor, enquanto sua evolução continua, adquirindo maior controle sobre suas habilidades.

No parlamento japonês, enquanto Godzilla avança pela cidade, o governo está em completo caos. As autoridades estão desorientadas e divididas sobre como reagir à ameaça. Alguns clamam por uma resposta militar imediata, enquanto outros se preocupam com as implicações internacionais e preferem uma análise mais cautelosa. O pânico cresce quando imagens de Godzilla chegam aos televisores, e a ideia de uma resposta nuclear é mencionada, mas descartada devido aos riscos. As autoridades convocam uma reunião de emergência com cientistas e especialistas para tentar entender a criatura, mas a sensação de impotência é clara. O governo não sabe como lidar com a magnitude da ameaça que se aproxima.