La historia comienza tras el final del torneo de la Ciudad Batalla, cuando Atem quiso recuperar sus recuerdos perdidos usando las Cartas de los Dioses Egipcios para activar la cámara del Rey Faraón Sin Nombre dentro del Mundo de la Memoria. De repente, una fuerza oscura congela la Tabla de los Recuerdos Perdidos, sellándola para impedirle hacerlo. Afuera, los Monstruos de Duelo han cobrado vida y han comenzado a atacar a los civiles sin previo aviso, incluso después de que Kaiba apagara el sistema de Duelo. Al ver que los monstruos seguían apareciendo, llamó a Ilusiones Industriales para pedir ayuda.

Ahora Yugi y sus amigos están en proceso de derrotar al malvado y famoso Dartz. "Muy bien, chicos... ¿están listos para derrotar a Dartz?" preguntó Yugi a sus amigos.